More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1724 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  82.59 
 
 		 202 aa  331  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  75.12 
 
 		 202 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  74.63 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  72.64 
 
 		 202 aa  290  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  72.14 
 
 		 202 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  70.15 
 
 		 202 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  59.31 
 
 		 202 aa  230  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  59.5 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  55.12 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  53.96 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  54.23 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  53.47 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  53.2 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  51.42 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  52.17 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 202 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  49.28 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.72 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.29 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.29 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  42.21 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  42.03 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  41.41 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>