More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2444 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  62.93 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  64.29 
 
 		 196 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  59.31 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  59 
 
 		 197 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  58.74 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  57.43 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 		 198 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  52.04 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  52.4 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  51.22 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  51.92 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  53.2 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 202 aa  194  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 202 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  50.73 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  48.85 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  51.5 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.24 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  47.32 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.24 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  47.2 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  44.88 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  46.73 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  48.54 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>