More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0480 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  98.09 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  93.3 
 
 		 209 aa  393  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  92.82 
 
 		 209 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  91.39 
 
 		 209 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  90.87 
 
 		 211 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  85.78 
 
 		 204 aa  360  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  83.33 
 
 		 209 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  79.41 
 
 		 204 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  78.43 
 
 		 204 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  78.43 
 
 		 204 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  76.7 
 
 		 209 aa  317  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  75.96 
 
 		 210 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  75.12 
 
 		 217 aa  309  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  63.73 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  61.27 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2916  riboflavin synthase subunit alpha  61.61 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0248627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  62.93 
 
 		 214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  62.44 
 
 		 237 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  61.24 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  59.31 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  59.3 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  56.94 
 
 		 201 aa  224  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0299  riboflavin synthase subunit alpha  60 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.931154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  49.52 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  51.98 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 223 aa  185  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.34 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  49.03 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  47.83 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  49.3 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  48.58 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  49.04 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.26 
 
 		 196 aa  168  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 232 aa  167  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  48.54 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>