More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1824 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  65.46 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  64.43 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 198 aa  247  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  63 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  61.78 
 
 		 196 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  58.65 
 
 		 208 aa  240  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  62.56 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  61.66 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  55 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  52.04 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  50.75 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  52.79 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  52.55 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  52.79 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  52.28 
 
 		 202 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  52.53 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  50.24 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 202 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  50.76 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.58 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 		 212 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  49.27 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  53.03 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  50.75 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  51.55 
 
 		 220 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  48.96 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  48.96 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  50.24 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.91 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.13 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 218 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 218 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>