More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0474 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  55 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  53.85 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  55.45 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  50.91 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  54.09 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  53.64 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  53.64 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  53.64 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  52.73 
 
 		 220 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  58.33 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  58.33 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  52.27 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  56.02 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  56.77 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  52.82 
 
 		 216 aa  214  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.4 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 201 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  47.69 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  54.08 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  52.88 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  53.17 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  51.13 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  53.85 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  50.94 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  52.66 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  52.66 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  52.66 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  54.17 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  45.75 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  50.98 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0299  riboflavin synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.931154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.09 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>