More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1379 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  52.73 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  51.13 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.3 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  51.03 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.91 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  48.23 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  45.45 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.44 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.82 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 213 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.42 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 199 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 220 aa  174  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  48.99 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.29 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.22 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.85 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45.95 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.65 
 
 		 187 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.99 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  42.92 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>