More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0899 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  60.37 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.49 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  56.19 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  53.24 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  48.39 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  48.34 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  53.92 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  51.92 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.86 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  45.66 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 193 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  51.39 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  52.94 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 200 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  56 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.99 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46.08 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 200 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.76 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  42.59 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  46.3 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.88 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 		 205 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.42 
 
 		 200 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  50.24 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  51.17 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  51.49 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>