More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0021 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  53.21 
 
 
218 aa  214  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  52.07 
 
 
218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  52.85 
 
 
216 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 
226 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 
214 aa  204  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 
214 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.51 
 
 
215 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  51.4 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
215 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  55.15 
 
 
223 aa  197  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  51.27 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 
215 aa  195  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  45.79 
 
 
214 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 
199 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 
220 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  51.15 
 
 
217 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  51.15 
 
 
217 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 
217 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 
214 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 
202 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
214 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  48.96 
 
 
201 aa  191  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.98 
 
 
215 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 
203 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
217 aa  188  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
214 aa  188  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
214 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  44.86 
 
 
214 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  44.86 
 
 
214 aa  187  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
205 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  47.74 
 
 
223 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 
205 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.26 
 
 
204 aa  184  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  51.34 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  47.39 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 
213 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  44.8 
 
 
222 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 
216 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.88 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.33 
 
 
213 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
209 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 
216 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 
216 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  45.67 
 
 
205 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 
203 aa  174  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.31 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.71 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  46.39 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  48.44 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 
220 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 
215 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  42.03 
 
 
208 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 
218 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 
220 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  43.72 
 
 
200 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 
219 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 
216 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 
221 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  48.69 
 
 
192 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 
220 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
203 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 
219 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  40.28 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 
219 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.81 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.2 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  40.41 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.58 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 
227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>