More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1689 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 217 aa  423  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  73.73 
 
 		 216 aa  315  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  61.75 
 
 		 214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  62.21 
 
 		 214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  59.91 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  54.09 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  55.76 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  50.9 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  53.57 
 
 		 200 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  46.33 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.25 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  44.24 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.44 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  49.46 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.49 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.02 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.94 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.7 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>