More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  58.29 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  61.14 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  54.77 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  55.38 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  56.16 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  53.92 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  55 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  55.33 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  56.12 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 217 aa  187  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.12 
 
 		 215 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  55.5 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  51.12 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 221 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  56.28 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  51.96 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  55.1 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  56.22 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  48.56 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  52.97 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  52.6 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  51.78 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.63 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  46.88 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  52.08 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  53.89 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  51 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  51.26 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  50.78 
 
 		 227 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  53 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  44.83 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  49.3 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 193 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  49.03 
 
 		 233 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  47.26 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.81 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 221 aa  158  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.88 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>