More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0177 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  56.46 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.1 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.2 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.34 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.8 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  42.18 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  37.91 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  44.04 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  44.83 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.23 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.95 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 219 aa  168  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  40.76 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  41.97 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  41.33 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.97 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.88 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  42.57 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  43.15 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  41.24 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 		 194 aa  158  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>