More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2833 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  74.74 
 
 		 199 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  71.35 
 
 		 202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  72.4 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  67.33 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  63.59 
 
 		 193 aa  251  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  66.84 
 
 		 215 aa  248  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  68.18 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  68.18 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  67.35 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  63.37 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  67.68 
 
 		 203 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  65.67 
 
 		 207 aa  247  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  68.21 
 
 		 205 aa  245  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  65.48 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  62.63 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  62.76 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  63.5 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  64.18 
 
 		 221 aa  236  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  62.87 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  62.31 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  62.62 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  60.19 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  57.99 
 
 		 227 aa  220  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  60 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  57.43 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.21 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 215 aa  201  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  55.1 
 
 		 196 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  55.28 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55.38 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  53.85 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  47.15 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  58.46 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  52.43 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  45.13 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  51.53 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  50.76 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  47.21 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  52.06 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.3 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  48.15 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.5 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  45.92 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  46.43 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  43.59 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>