More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1595 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  60.56 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  53.49 
 
 		 215 aa  227  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  51.4 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 226 aa  187  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.07 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  46.64 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.53 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.49 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45.79 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.19 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  45.73 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  43.05 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  47.15 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  42.92 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  47.67 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.62 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>