More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1868 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  85.07 
 
 		 221 aa  354  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  68.81 
 
 		 203 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  71.79 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  68.78 
 
 		 201 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  63.4 
 
 		 193 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  65.48 
 
 		 202 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  65 
 
 		 223 aa  241  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  65.52 
 
 		 203 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  70 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  67.53 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  62.87 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  61.46 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  62 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  62.07 
 
 		 202 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  65.66 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  63.77 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 		 210 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  63.96 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  60.91 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  58.79 
 
 		 200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  56.65 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  58.62 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  57.27 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  55.05 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  58.54 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  55.22 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  57.22 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  54.77 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.57 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55.5 
 
 		 204 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  52.91 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  49.78 
 
 		 251 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  52.55 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  52.74 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  51.42 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  58.79 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  45.23 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  48.65 
 
 		 187 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  44.28 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50.26 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  53.06 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.26 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  47.21 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>