More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3107 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  69.54 
 
 		 202 aa  268  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  73 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  63.37 
 
 		 202 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  63.68 
 
 		 201 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  63.37 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  65 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  64.36 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  63.55 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  59.82 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  63.32 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  64.65 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  62.38 
 
 		 203 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  62.38 
 
 		 203 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  62.04 
 
 		 212 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  63.51 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  61.88 
 
 		 203 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  59.62 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  60 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  60.09 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  62.86 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  59.51 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  57.07 
 
 		 193 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  57.29 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  54.82 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  58.42 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  51.75 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  52.7 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  51.83 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  52.02 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  47.74 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  51.89 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.26 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  51.78 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  49 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  51.26 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  48.26 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.39 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.54 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.32 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.24 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.24 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.27 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.55 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  47.3 
 
 		 251 aa  167  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.45 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  53.01 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.61 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.72 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  46.45 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.06 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.88 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>