More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10860 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
218 aa  424  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  54.33 
 
 
210 aa  208  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  53.47 
 
 
226 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  53.43 
 
 
222 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 
209 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 
207 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  51.42 
 
 
220 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.54 
 
 
210 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  47.83 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 
203 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  49.3 
 
 
204 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.79 
 
 
202 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.38 
 
 
204 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 
200 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.2 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  53.63 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  45.74 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  47.85 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  49.77 
 
 
214 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 
202 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 
218 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 
203 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 
205 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 
238 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 
219 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 
217 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.15 
 
 
204 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 
196 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 
202 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 
221 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 
193 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  33.94 
 
 
217 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 
221 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  36.14 
 
 
217 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
196 aa  148  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 
204 aa  148  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.08 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.14 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  48.82 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 
198 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 
219 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 
227 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 
208 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 
217 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
218 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 
221 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 
198 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 
223 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
213 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
200 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 
203 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 
205 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
220 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 
221 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 
220 aa  141  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 
209 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  41.23 
 
 
203 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 
196 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  39.5 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  41.43 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  33.78 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  39.32 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  34.88 
 
 
218 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  41.67 
 
 
220 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 
217 aa  138  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 
219 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  40.19 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
220 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 
187 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 
205 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 
209 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.39 
 
 
216 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.54 
 
 
217 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  39.61 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>