More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1619 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  65.6 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  58.9 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  61.09 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 		 218 aa  257  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 		 196 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  49.21 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.18 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  46.11 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  45.08 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.63 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.79 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.07 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  47.15 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.9 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  44.32 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  43 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  45.27 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>