More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1273 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 199 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  53.69 
 
 		 202 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  49.78 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  49.51 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51.2 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 205 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.6 
 
 		 212 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 193 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  51 
 
 		 208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  50.49 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  47.3 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  48.89 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 214 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.2 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  49.53 
 
 		 208 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 214 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.29 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 201 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  41.46 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.04 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 215 aa  159  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  44.7 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  37.18 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  37.18 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.55 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  45.33 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.83 
 
 		 201 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  48.33 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  50.29 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 203 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 215 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  48.85 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.57 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.14 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  45.97 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.08 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 218 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  48.35 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  46.6 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.82 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.47 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  44.05 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  43.2 
 
 		 198 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  42.44 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 201 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>