More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1403 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  83.82 
 
 
201 aa  343  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  65.7 
 
 
203 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  64.82 
 
 
192 aa  247  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 
199 aa  187  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  48.56 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 
223 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 
201 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.28 
 
 
202 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 
209 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  49.04 
 
 
208 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 
226 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.5 
 
 
202 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 
205 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 
203 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  45.81 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.31 
 
 
201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 
205 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
215 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 
193 aa  160  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
215 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 
217 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 
222 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 
217 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 
215 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 
221 aa  157  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  43.84 
 
 
197 aa  157  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 
227 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 
216 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 
212 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.37 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.27 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 
226 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
220 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  50.28 
 
 
211 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 
196 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 
204 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 
214 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 
218 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
195 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.78 
 
 
217 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
221 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 
214 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 
194 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
224 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 
238 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  42.18 
 
 
205 aa  149  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.19 
 
 
217 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 
213 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 
204 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 
210 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  44.55 
 
 
210 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 
223 aa  148  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  45.64 
 
 
212 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  43.5 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.38 
 
 
200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  38.92 
 
 
215 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 
230 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
214 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
219 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  48.04 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 
214 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 
216 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
218 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
219 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 
214 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
210 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
217 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 
217 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 
201 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
210 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 
210 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.51 
 
 
217 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 
209 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
251 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 
216 aa  141  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 
196 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 
216 aa  141  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 
217 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  41.98 
 
 
232 aa  141  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 
223 aa  140  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
215 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 
223 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>