More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1926 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  66.49 
 
 		 194 aa  271  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  62.3 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  59.07 
 
 		 197 aa  247  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  56.48 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  57.22 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  55.33 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  49.23 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  43.32 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  42.23 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.75 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  48.05 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.78 
 
 		 208 aa  150  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 214 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 218 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.59 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  38.38 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  37.63 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  38.97 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 214 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 226 aa  138  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.06 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  39.29 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  38.34 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 251 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  34.54 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  37.11 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  36.98 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  38.46 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  36.68 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.6 
 
 		 217 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 214 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  37.69 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  35.9 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  36.65 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>