More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2925 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
215 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  99.07 
 
 
215 aa  410  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  96.28 
 
 
215 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  87.2 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 
216 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 
202 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 
216 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
202 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 
205 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
202 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.98 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 
208 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.97 
 
 
213 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  43.93 
 
 
214 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 
197 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
205 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 
215 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
221 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 
201 aa  167  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
218 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 
202 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 
217 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 
197 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 
205 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  49.02 
 
 
211 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
213 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 
207 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 
218 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  45.08 
 
 
217 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  47.42 
 
 
212 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 
205 aa  165  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  49.23 
 
 
208 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  47.37 
 
 
207 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.5 
 
 
202 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 
200 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 
217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  47.89 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 
204 aa  164  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.19 
 
 
200 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 
220 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  51.72 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  48.36 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 
204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 
201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  41.43 
 
 
216 aa  161  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 
221 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  48.1 
 
 
226 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 
200 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
196 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 
201 aa  161  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 
204 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
221 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  43.18 
 
 
227 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
221 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
221 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 
205 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 
198 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 
199 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
203 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.7 
 
 
223 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
232 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 
223 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  45.15 
 
 
208 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
219 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
219 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 
203 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 
215 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 
218 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 
208 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 
216 aa  157  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 
220 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 
220 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 
204 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 
219 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
193 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 
203 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>