More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0650 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  64.4 
 
 
198 aa  269  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  61.26 
 
 
194 aa  254  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  62.3 
 
 
195 aa  252  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  59.16 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  57.36 
 
 
200 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  55.61 
 
 
200 aa  230  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  58.12 
 
 
197 aa  229  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  46.91 
 
 
196 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 
218 aa  159  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  42.36 
 
 
223 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  42.02 
 
 
212 aa  157  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 
217 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
216 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 
219 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.82 
 
 
200 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 
215 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 
215 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 
216 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
218 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 
205 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 
215 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 
215 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 
210 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 
221 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 
215 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
219 aa  147  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
226 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 
211 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
203 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 
223 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  34.02 
 
 
217 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  38.58 
 
 
202 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 
219 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 
209 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  40.7 
 
 
208 aa  141  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  35.96 
 
 
204 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  39.7 
 
 
215 aa  141  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
199 aa  141  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 
212 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 
217 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 
220 aa  141  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  36.55 
 
 
199 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 
196 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.92 
 
 
213 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
221 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  37.63 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  38.38 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.82 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  34.52 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  38.54 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  37.76 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  37.95 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  37.24 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  36.73 
 
 
239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  36.46 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 
217 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 
218 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 
217 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 
220 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  38.34 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.34 
 
 
227 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 
223 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
223 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
218 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  38.66 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
221 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  35.82 
 
 
204 aa  137  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
223 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
208 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  35.2 
 
 
196 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 
214 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  36.46 
 
 
196 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
217 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.14 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  36.98 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  35.71 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  34.72 
 
 
217 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 
201 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  34.8 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  34.8 
 
 
229 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>