More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02325 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  64.4 
 
 		 196 aa  269  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  64.58 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  61.98 
 
 		 194 aa  253  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  58.88 
 
 		 197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  59.39 
 
 		 200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 195 aa  238  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  59.39 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  50.78 
 
 		 196 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 223 aa  177  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  46.28 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.84 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  44 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  48.19 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.35 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.35 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 221 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.08 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.38 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 239 aa  148  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.78 
 
 		 217 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 		 214 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.24 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  40.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  43.65 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  40.19 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  41.45 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  41.84 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  41.83 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  39.79 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  41.79 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 214 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  40.51 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 217 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>