More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1365 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  58.76 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  53.09 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  54.92 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  55.33 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.3 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  55.44 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  47.92 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  53.37 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.85 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  53.03 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  52.31 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  51.81 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.75 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  51.55 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  46.11 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  50.98 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  43.33 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.73 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  51.01 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 205 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.19 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  48.7 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.35 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  42.19 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 		 200 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  47.15 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.42 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50.31 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>