More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1416 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  75.56 
 
 		 225 aa  344  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  58.52 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  57.59 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  55.9 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  55.9 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  54.73 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  41.89 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.62 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.49 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.27 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.35 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  40.35 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.5 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 209 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.35 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  48.8 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  45.27 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40.44 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.16 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  38.07 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  40.19 
 
 		 209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  41.21 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  39.9 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>