More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0604 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  75.68 
 
 		 218 aa  337  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  68.02 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 217 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 217 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  52.25 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  44.69 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.7 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.37 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.16 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  47.6 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  49.3 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.68 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.54 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.72 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.74 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.74 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.26 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.23 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  43.17 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  46.45 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  45.71 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.54 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.85 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  47.32 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>