More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1758 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  75.68 
 
 		 222 aa  337  9e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 220 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  54.38 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  54.38 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 217 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  49.31 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  50.67 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  45.26 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  44.84 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.53 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  46.02 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  51.26 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  45.98 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.84 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 199 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  41.39 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  40.44 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  43.05 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.53 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.6 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  43.17 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  38.91 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>