More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1250 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  99.56 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  67.69 
 
 		 230 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  55.02 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  55.9 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  54.27 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  51.93 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 217 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.74 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  38.56 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.72 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 215 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.23 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.48 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.69 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.17 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 204 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40.38 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.52 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  38.43 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  38.79 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.95 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.03 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  36.4 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  40.26 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  40.42 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  40.95 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.72 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.38 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 205 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  39.57 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>