More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0879 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 200 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.03 
 
 		 213 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.41 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  45.03 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 215 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 217 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.55 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.03 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.79 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 223 aa  148  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 214 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.5 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.88 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 222 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  42.19 
 
 		 218 aa  144  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.27 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.38 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.84 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  40.51 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  36.92 
 
 		 239 aa  141  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  46.25 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 222 aa  140  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.84 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  40.84 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  36.65 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  37.82 
 
 		 217 aa  137  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 220 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  39.27 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 220 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  48.03 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  41.88 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.02 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>