More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2883 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 215 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  47.47 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  44.16 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.67 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.08 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  43.94 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.46 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.7 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  41.58 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  41.86 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.07 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.83 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.07 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.28 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  38.25 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  38.57 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  39.58 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  39.6 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  43.59 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.74 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.22 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.07 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  42 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0773  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>