More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0123 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  48.56 
 
 
226 aa  214  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  49.03 
 
 
216 aa  214  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  52.11 
 
 
215 aa  209  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 
218 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  53.3 
 
 
217 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  53.3 
 
 
217 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 
215 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.89 
 
 
215 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  51.27 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 
215 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 
214 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  51.74 
 
 
217 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 
221 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 
205 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 
216 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.21 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 
205 aa  182  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.98 
 
 
202 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  45.19 
 
 
216 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
187 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.21 
 
 
202 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 
210 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  44.06 
 
 
211 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
200 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  42.51 
 
 
217 aa  178  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
214 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.18 
 
 
218 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  45.1 
 
 
204 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 
220 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 
213 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 
216 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 
193 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.08 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.6 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 
213 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  46.98 
 
 
212 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.67 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
221 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43.54 
 
 
220 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 
227 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 
216 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 
220 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 
220 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 
221 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 
200 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  43.33 
 
 
220 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 
208 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 
204 aa  167  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 
216 aa  167  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 
220 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 
223 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
221 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
221 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
209 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
221 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  49.71 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 
221 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 
203 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
211 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 
196 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  46.6 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  46.48 
 
 
205 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 
221 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  45.59 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>