More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1078 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  69.04 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  62.93 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  65.15 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  63.55 
 
 		 223 aa  240  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  65.2 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  63.18 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  65.17 
 
 		 203 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  63 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  65.35 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  65.35 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  64.85 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  65.66 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  64.65 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  64.36 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  68.37 
 
 		 212 aa  227  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  60.5 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 		 215 aa  217  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  59.9 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  61.39 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  56.74 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  59.02 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  55.31 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  57.49 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  53.66 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  52.17 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.46 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.61 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  56.12 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.98 
 
 		 223 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  51.98 
 
 		 227 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  52.26 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  57.5 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  52.28 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 220 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 226 aa  177  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  52.28 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  48.8 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  52.02 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  48.74 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  46.43 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.41 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>