More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1446 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  54.09 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50.68 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  51.39 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  49.07 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.15 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  49.54 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.13 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  44.91 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.12 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.06 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  46.05 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  49.72 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.67 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 205 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  45.28 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  40.28 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>