More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1624 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  55.46 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  55.02 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  53.31 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  55.65 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  53.54 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  51.33 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  47.75 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  50.67 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.95 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  44.69 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.7 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  45.29 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  42.15 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  49.21 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.05 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  48.58 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.8 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.47 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.59 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  40.45 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.52 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  41.52 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  47.76 
 
 		 200 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.44 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 201 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  42.2 
 
 		 205 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.8 
 
 		 201 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>