More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1857 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  69.64 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  65.65 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  66.36 
 
 		 218 aa  287  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  62.27 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  60.54 
 
 		 224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.99 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.82 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 196 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  48.15 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.91 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.7 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.55 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 199 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.2 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.2 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  37.73 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  39.01 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>