More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1625 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  73.73 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  61.11 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  60.55 
 
 		 214 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  47.75 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  47.93 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  51.55 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46.08 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.49 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  49.54 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.84 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  47.27 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  51.79 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.33 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.91 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.91 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.54 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.86 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  46.88 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.04 
 
 		 220 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  44.64 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  40.28 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.75 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  47.47 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 196 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.28 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 219 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>