More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1160 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  43.6 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.1 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  44.83 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.27 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.73 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  46.35 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.15 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  44.79 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  46.35 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.92 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.06 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.58 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  47.92 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 218 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 218 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  43.06 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 219 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  43.75 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.2 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.15 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.62 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  40.8 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>