More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2766 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  60.1 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 217 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  48.96 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  51.69 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  52.6 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.62 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.13 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  51.01 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  51.3 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  52.43 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.13 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  53.06 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  47.09 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50.88 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  49.74 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  44.86 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  46.07 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.24 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.76 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  49.51 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.11 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  46.11 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  46.31 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  43.88 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.65 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  52 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.39 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.22 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  45.63 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  46.27 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>