More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04971 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  95.39 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  88.02 
 
 		 217 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  78.34 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  49.31 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  51.15 
 
 		 217 aa  224  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  51.15 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  47.75 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  41.99 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  46.4 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 225 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  41.32 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.24 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  47.12 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.36 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  43.66 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  43.75 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  41.94 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  42.53 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0299  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.931154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  45.15 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  35.14 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.36 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.13 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.01 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  40.78 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.28 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  37.72 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>