More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2562 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  73.5 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  72.95 
 
 		 203 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  72.95 
 
 		 203 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  72.46 
 
 		 203 aa  287  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  71.36 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  68.81 
 
 		 201 aa  268  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  67.96 
 
 		 203 aa  267  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  69.5 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  65.67 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  65.17 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 220 aa  237  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  63.37 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  59.62 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  59.9 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  62.56 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  61.88 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  60.1 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  56.6 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  59.51 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  55.39 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  59.02 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  60.19 
 
 		 204 aa  208  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 227 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  55.5 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  53.73 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  54.73 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  52.91 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.26 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.34 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  51 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.23 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.59 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.26 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  46.86 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  45.77 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.51 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  43.9 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  49.05 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.27 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 251 aa  157  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.54 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>