More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1670 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
226 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  83.71 
 
 
222 aa  357  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  61.06 
 
 
208 aa  234  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  62.31 
 
 
199 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  56.93 
 
 
209 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 
221 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  54.04 
 
 
215 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  54.55 
 
 
220 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  55.72 
 
 
203 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  55.72 
 
 
203 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  55.72 
 
 
203 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  51.75 
 
 
223 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  53.4 
 
 
210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  56.65 
 
 
202 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55.56 
 
 
204 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  55.28 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.71 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  53.59 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  53.66 
 
 
205 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 
218 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 
201 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  56.25 
 
 
204 aa  191  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
227 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.85 
 
 
212 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  51.23 
 
 
193 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51.44 
 
 
217 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  51.2 
 
 
205 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  49.27 
 
 
207 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  52.15 
 
 
203 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  52.2 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
204 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  49.51 
 
 
233 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.59 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  51.52 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 
219 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  52.22 
 
 
202 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 
219 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 
208 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 
215 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 
218 aa  165  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
215 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
196 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  48.04 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 
216 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 
220 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  48.04 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.62 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  48.1 
 
 
215 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 
220 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48.1 
 
 
215 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 
221 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.78 
 
 
200 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 
208 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40.98 
 
 
207 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 
217 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 
220 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 
215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 
221 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 
217 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 
227 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  48.33 
 
 
205 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  45.15 
 
 
198 aa  158  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 
214 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
200 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 
216 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 
196 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 
251 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  48.33 
 
 
218 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 
217 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 
220 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 
219 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
200 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 
196 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 
219 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 
220 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
219 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 
201 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  44.81 
 
 
207 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 
220 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
213 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.19 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
215 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
205 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 
200 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  41.92 
 
 
204 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  43.78 
 
 
216 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.5 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  42.5 
 
 
197 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
214 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 
221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>