More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1696 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  54.4 
 
 
197 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  54.74 
 
 
194 aa  228  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  52.53 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  50.78 
 
 
198 aa  218  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 
196 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
200 aa  193  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  47.87 
 
 
212 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 
218 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 
217 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 
218 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.41 
 
 
213 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  43.01 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 
216 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.08 
 
 
215 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 
199 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.31 
 
 
199 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  40.84 
 
 
215 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
217 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
217 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 
226 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 
223 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 
208 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 
223 aa  154  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
218 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.69 
 
 
200 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
193 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 
217 aa  153  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 
219 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  42.19 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  40.91 
 
 
202 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 
201 aa  151  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 
208 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
220 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 
205 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
215 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 
219 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  40.3 
 
 
223 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 
217 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  40.67 
 
 
208 aa  148  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  37.06 
 
 
214 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
221 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 
220 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  38.73 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
208 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
218 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 
222 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 
198 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 
204 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 
198 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
205 aa  143  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 
205 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
216 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  40.29 
 
 
205 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
205 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
214 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 
192 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
220 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
215 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
203 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
214 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
218 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
215 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 
224 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
200 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
200 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  37.76 
 
 
203 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  39.22 
 
 
210 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 
212 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  36.98 
 
 
211 aa  141  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 
214 aa  141  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 
200 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 
216 aa  141  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 
196 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  37.31 
 
 
201 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.63 
 
 
217 aa  141  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
220 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.63 
 
 
217 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  38.89 
 
 
198 aa  141  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  37.56 
 
 
227 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.04 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.79 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  36.92 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>