More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0681 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  54.33 
 
 		 218 aa  208  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  46.38 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  47.14 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  42.51 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.41 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  42.21 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.5 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  45.81 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.9 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  40.95 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  42 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.35 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  40.3 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  36.95 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  46.24 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  35.68 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  35.24 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  37.91 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.39 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  40.3 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  36.14 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  38.24 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  36.62 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  38.16 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  38.21 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.28 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  36.97 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1684  Lumazine-binding protein  42.71 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  38.35 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>