More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0293 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  67.84 
 
 		 197 aa  280  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  57.44 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  59.39 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  57.36 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  55.33 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  55.1 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  52.53 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 200 aa  217  7.999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  45.81 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  40.8 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  40.39 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  44.02 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.4 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  45.23 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.73 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  45.57 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  42 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.1 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  39 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.12 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  40.69 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.8 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  40.39 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 		 221 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  34.01 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  38.19 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  36.68 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  37.44 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  38.1 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  39.6 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>