More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06150 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  51.08 
 
 
234 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  46.38 
 
 
237 aa  202  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  53 
 
 
216 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 
215 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  41.96 
 
 
232 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 
203 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.37 
 
 
217 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 
201 aa  161  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
218 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.9 
 
 
205 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 
214 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
216 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.35 
 
 
200 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 
205 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
216 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
217 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 
232 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 
205 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 
217 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  42.64 
 
 
208 aa  151  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 
215 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
220 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 
218 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  41.62 
 
 
214 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 
216 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  41.41 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
218 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40.45 
 
 
207 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
217 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.58 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 
193 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 
214 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
218 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  41.92 
 
 
227 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 
220 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  41.41 
 
 
204 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 
199 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.82 
 
 
202 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 
219 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
221 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 
214 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
221 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
192 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  38.16 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  39.02 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  40.48 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
217 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 
205 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  38.78 
 
 
220 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 
207 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
221 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  35.86 
 
 
239 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
221 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  40.7 
 
 
215 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
220 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
223 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.24 
 
 
217 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.33 
 
 
201 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 
214 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 
216 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 
214 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  37.24 
 
 
219 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  37.24 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>