More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40556 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  56.22 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  46.38 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  42.39 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  48.33 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  44.6 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  47.09 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.6 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.87 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 205 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 		 205 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.41 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.36 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  36.49 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  38.42 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  44.97 
 
 		 187 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  42.23 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  41.46 
 
 		 202 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  40.78 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.21 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  36.77 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.95 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.6 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39.51 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  37.39 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 		 193 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  38.1 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  40.19 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.38 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  36.71 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  39.23 
 
 		 205 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  35.22 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  36.96 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  36.71 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  36.32 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>