More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1727 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  61.81 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  61.42 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  61.22 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  58.46 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  59.2 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  56.57 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  58.79 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  57.5 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  53.17 
 
 		 217 aa  194  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  56.41 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  55 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  49.05 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  54.64 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  52.28 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  52.06 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  48.79 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  49.25 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.73 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.72 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  48.04 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.18 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.18 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  49.42 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  47.55 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 218 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.62 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.94 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>