More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4152 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 233 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  54.93 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 		 215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  53.81 
 
 		 200 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  55.35 
 
 		 204 aa  194  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  50.64 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  51.09 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  54.42 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  52.56 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  54.81 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  50.44 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  54.13 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  51.57 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  53.52 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  52.88 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51.87 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  50.72 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 193 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.23 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.6 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  49.13 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  52.66 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  47.68 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  49.05 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.09 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.09 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.09 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.09 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  46.52 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.02 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  43.19 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.8 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 		 201 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43.86 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.95 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  48.8 
 
 		 202 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.71 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.51 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.23 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  45.29 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2916  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0248627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  47.6 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.71 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.28 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  45.29 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  48.57 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  44.29 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 211 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>