More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0301 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  53.59 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.48 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.29 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  46.01 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  49.53 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  47.32 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  45.1 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.02 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.66 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.34 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.58 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.16 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.05 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  48.02 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.15 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  36.76 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  38.28 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  44.66 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  45.93 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  45.29 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  44.66 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>