More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1822 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
210 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
210 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  77.62 
 
 
210 aa  338  5e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 
217 aa  192  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 
215 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
214 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 
214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  45.13 
 
 
214 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 
214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.19 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 
214 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 
226 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 
218 aa  167  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
221 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 
217 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 
217 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.81 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.72 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.18 
 
 
217 aa  161  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  38.03 
 
 
216 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 
199 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
214 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 
221 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.13 
 
 
199 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 
216 aa  155  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 
208 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 
215 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
193 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  44.9 
 
 
214 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
220 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  39.6 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  41.38 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  43.01 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.21 
 
 
202 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.34 
 
 
211 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.47 
 
 
216 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 
201 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 
192 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 
187 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
217 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  38.89 
 
 
200 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 
204 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 
210 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.35 
 
 
210 aa  147  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.96 
 
 
217 aa  147  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.29 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.8 
 
 
239 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37 
 
 
200 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
205 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 
223 aa  144  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  37.44 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
217 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 
220 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 
208 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  38.97 
 
 
215 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 
221 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 
205 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
220 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  35.65 
 
 
218 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 
205 aa  141  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
203 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  39.7 
 
 
205 aa  141  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.04 
 
 
217 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 
221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  44.27 
 
 
212 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 
221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 
221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 
203 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  35.35 
 
 
217 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  39.06 
 
 
202 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  37.37 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  36.53 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  35.19 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  35.19 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  36.45 
 
 
251 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>